现新疆野苹果果实形状有近圆形、椭圆形、扁圆形、卵圆形等7个类型，果实果面光滑，无果粉，有些具棱起，果形端正对称，果点少，多数无果锈，萼片多聚合宿存，梗洼深度及广狭以中等类型居多，心室闭合，香气较浓，具有栽培苹果的特征，同时还发现新疆野苹果果肉汁液较少，果肉多绵软，味酸，果心约占果实纵切面的近1/2，这与栽培苹果存在一定差异。果实形状有7种类型，以近圆形为主，其次为卵圆形，扁圆形、椭圆形、圆锥形、偏斜形则分布较少，短圆锥形最少；果实风味有6种类型，遗传多样性指数达1.069，以酸型居多，甜酸次之，淡甜、酸甜、酸甜适度、极酸较少；果肉质地有4种类型，遗传多样性指数达1.110，其中绵软型最多，松软、松脆相对较少，硬脆最少；萼片有聚合和反卷两种类型，其中以聚合为主，部分反卷；萼洼多中狭型。